A. FIXTURES_DIR 環境変数を指定する
(Rails 4系で確認)
rake db:fixtures:load FIXTURES=users FIXTURES_DIR=../../spec/fixtures
rake タスクだと固定で test/fixtures を見に行くので、../../ 指定で見に行くディレクトリを遡らせる
dotenv を使っているなら、そこで FIXTURES_DIR を定義して、bundle exec rake するのもいいかもしれない